Behandling är inte aktuellt under svenska förhållanden utan ett smittat djur tas om hand enligt myndigheternas anvisning. Om rots misstänks så ska djuret isoleras direkt och myndigheterna kontaktas enligt författning SJVFS 2021:10 K12. Därefter fås anvisningar om stallrengöring och desinfektion.
Karantän och provtagning av hästar som kommer från endemiska områden är nödvändigt för att kontrollera att de inte bär på infektionen. Det finns inget vaccin mot rots.