Mul- och klövsjukevirus tillhör genus Aphtovirus inom familjen Picornaviridae. Det finns sju olika serotyper mellan vilka skyddande korsimmunitet inte föreligger. Baserat på antigena skillnader kan sedan varje serotyp indelas i subtyper. Inte heller mellan subtyper föreligger fullständig skyddande korsimmunitet. Totalt finns över 60 sådana subtyper.

Virus tål uttorkning, kyla, alkohol och ett flertal kemiska desinfektionsmedel. Det inaktiveras av solljus men kan överleva länge i kontaminerad omgivning vid rätt klimatbetingelser. Även i kött- och köttprodukter är överlevnadsförmågan god. I ruttnande kadaver inaktiveras dock virus på grund av lågt pH. I fuktig värme avdödas virus vid 60–70°C under 15 minuter. Det är relativt pH-känsligt och inaktiveras vanligen snabbt utanför området pH 7–9. Viss variation i känslighet förekommer dock och under praktiska betingelser bör man räkna med stabilitet mellan pH 4 och 11. Som desinfektionsmedel används bl.a. NaOH 2 % och formalin. För handdesinfektion och liknande kan citronsyralösning användas.